Bencana melanda ketika seorang dalang kriminal mengungkapkan identitas semua agen rahasia yang aktif di Inggris. Dinas rahasia kini hanya dapat mengandalkan satu orang – Johnny English. Saat ini mengajar di sekolah persiapan kecil, Johnny kembali beraksi untuk menemukan peretas misterius itu. Agar misi ini berhasil, ia akan membutuhkan semua keterampilannya – meskipun sedikit yang dimilikinya – saat pria dengan metode analog masa lalu berhadapan dengan teknologi digital masa depan.