Sensasi pop Alvin, Simon, dan Theodore berakhir dalam perawatan keponakan Dave Seville yang berusia dua puluhan, Toby. Anak-anak lelaki itu harus mengesampingkan ketenaran musik untuk kembali ke sekolah, dan ditugaskan untuk menyelamatkan program musik sekolah dengan memenangkan hadiah $25.000 dalam pertarungan band. Namun, para Chipmunk secara tak terduga bertemu dengan tandingan mereka, tiga Chipmunk yang bernyanyi yang dikenal sebagai Chipettes – Brittany, Eleanor, dan Jeanette. Percikan romantis dan musikal menyala ketika para Chipmunk dan Chipettes saling berhadapan.