Musim panas tahun pertamanya di sekolah menengah atas, Hodaka kabur dari pulau terpencil tempat tinggalnya ke Tokyo, dan segera menyadari dirinya terdesak hingga ke batas keuangan dan pribadinya. Cuacanya luar biasa suram dan hujan setiap hari, seolah-olah terinspirasi dari kehidupannya. Setelah berhari-hari menyendiri, ia akhirnya menemukan pekerjaan sebagai penulis lepas untuk sebuah majalah gaib yang misterius. Kemudian, suatu hari, Hodaka bertemu Hina di sudut jalan yang ramai. Gadis yang cerdas dan berkemauan keras ini memiliki kemampuan yang aneh dan menakjubkan: kekuatan untuk menghentikan hujan dan menjernihkan langit.