Seorang rekrutan baru di departemen kepolisian Gotham City milik Kapten Sarah Essen, detektif James Gordon dipasangkan dengan Harvey Bullock untuk memecahkan salah satu kasus paling terkenal di Gotham: pembunuhan Thomas dan Martha Wayne. Selama penyelidikannya, Gordon bertemu dengan putra Wayne, Bruce, yang sekarang dirawat oleh kepala pelayannya Alfred Pennyworth, yang semakin mendorong Gordon untuk menangkap pembunuh misterius itu. Sepanjang perjalanan, Gordon harus menghadapi mafia wanita Fish Mooney, mafia yang dipimpin oleh Carmine Falcone, serta banyak penjahat masa depan Gotham seperti Selina Kyle, Edward Nygma, dan Oswald Cobblepot. Akhirnya, Gordon dipaksa untuk menjalin persahabatan yang tidak biasa dengan Wayne, yang akan membantu membentuk masa depan bocah itu dalam takdirnya untuk menjadi seorang pejuang.