Falling Skies dibuka dengan latar belakang kekacauan setelah serangan alien yang membuat sebagian besar dunia lumpuh total. Dalam enam bulan sejak invasi awal, beberapa orang yang selamat telah berkumpul bersama di luar kota-kota besar untuk memulai tugas sulit melawan. Setiap hari adalah ujian bertahan hidup saat tentara warga bekerja untuk melindungi orang-orang yang mereka rawat sambil juga terlibat dalam kampanye pemberontakan melawan pasukan alien yang menduduki.