Berlatar belakang India pascakolonial, Qissa menceritakan tentang Umber Singh, seorang Sikh yang terpaksa meninggalkan desanya akibat pembersihan etnis pada masa pemisahan tahun 1947. Umber memutuskan untuk melawan takdir dan membangun rumah baru untuk keluarganya. Ketika Umber menikahkan anak bungsunya, Kanwar, dengan Neeli, seorang gadis dari kasta rendah, keluarga itu dihadapkan dengan kebenaran identitas mereka; saat ambisi dan takdir masing-masing bertabrakan dalam perjuangan melawan keabadian.