Apa yang akan terjadi jika Shiroyasha tidak pernah ada? Edo dilanda kekacauan karena suatu sebab yang misterius. Sakata Gintoki kini hidup di dunia yang masa depannya telah berubah, tanpa dirinya. Apa yang terjadi dengan Yorozuya? Gintoki yang kini menjadi hantu masa lalu, harus sekali lagi menanggung beban demi menyelamatkan teman-temannya. Ia harus menyelesaikan pekerjaan terbesar yang pernah ada, yang mungkin merupakan pekerjaan terakhir Yorozuya.