Dulunya detektif remaja yang brilian, Shinichi Kudo, diberi racun yang mengubahnya menjadi anak berusia 4 tahun. Ia menggunakan nama samaran Conan Edogawa agar tidak seorang pun (kecuali seorang penemu yang eksentrik) tahu. Sekarang ia harus memecahkan serangkaian pengeboman sebelum orang-orang yang dicintainya menjadi korban. Siapa orang gila ini dan mengapa ia melakukan ini? Hanya si jenius muda yang dapat menyelamatkan hari itu, tetapi apakah ia mampu melakukannya?