Sammy dan Ray, penyu belimbing dan sahabat sejati, sedang menikmati air dan pasir di sebuah atol, menggembalakan bayi penyu, Ricky dan Ella, ke laut. Tiba-tiba, seorang pemburu gelap datang dan mengirim mereka untuk menjadi bagian dari pertunjukan akuarium spektakuler bagi wisatawan di Dubai. Gembong tempat itu, Big D si kuda laut, mengajak mereka dalam rencananya untuk melarikan diri. Namun, bersama teman-teman baru mereka, Jimbo si ikan gumpalan bermata besar dan Lulu si lobster yang gesit, Annabel si gurita manis, dan sekeluarga penguin, Sammy dan Ray membuat rencana pelarian mereka sendiri. Saat itulah Ricky dan Ella kecil tiba, bertekad untuk menyelamatkan mereka. Setelah serangkaian petualangan mendebarkan dan lolos dari maut, para pahlawan kita menuju selatan untuk bertemu Shelly, cinta pertama dan satu-satunya Sammy.